Hallöchen,
nach 1 Tag kann man ganz gut sehen, dass die befruchteten Eier dunkler werden, während die unbefruchteten ganz hell bleiben und sogar weißer werden. Je nachdem wie sie aneinander kleben ist es nicht ganz risikolos, die voneinander zu trennen. Lose unbefruchtete in jedem Fall raus picken. Kannst du ja, wenn du noch unsicher bist, einfach in ein anderes Pöttchen geben und beobachten, ob es doch noch dunkler wird.
Zu früh würde ich nicht sortieren, da bei den Eiern ein paar Stunden Legeabstand schon einen Unterschied in der Färbung ausmachen. Ganz frisch gelegte kann man m. E. nicht unterscheiden (kann aber artenabhängig sein). Daher würde ich immer 1 Tag warten, es sei denn, es zeigen sich schon Haare.
Die unbefruchteten werden auch im Gegensatz zu den befruchteten weicher und platzen schnell bzw. lassen sich ganz leicht quetschen.
Wegen der Verpilzung einfach auch mal ein Stück überbrütes Buchenlaub in den Pott legen.